Binning
装仓是一种提高相机帧速率和动态范围,同时通过降低分辨率来降低噪声的技术。它通常用于高速荧光延时实验。而不是读出每个人的数据 像素点 ,相邻像素的数据被合并并一起作为超像素读出。通常使用2x2和8x8之间的合并值。重要的是要注意2x2装箱生成的像素是原始像素大小的4倍。
效果分级取决于相机中使用的传感器类型,如下表所示。
速度 | 数据量 | 解析度 | 信噪比 | |
CCD | ↑ | ↓ | ↓ | ↑ |
电磁兼容 | ↑ | ↓ | ↓ | ↑ |
CMOS | ↔ | ↓ | ↓ | ↔ |
CMOS | ↔ | ↓ | ↓ | ↔ |
Bit-Depth
Brightness
亮度描述相对 强度 影响人或传感器。在数字图像的情况下,强度是整个传感器的平均值。
颜色查询表(CLUT)
数字图像由单个像素的阵列组成。它们的颜色信息可以存储为数字代码,其中每种颜色均以不同的数值存储。
颜色查询表是一个索引,用于存储这些值,这些值主要基于 RGB 色彩空间,通常用于监视器演示。
针对特定用途选择合适的颜色查询表取决于用户自己的判断和需求。但是,经验表明,某些颜色查询表对于特定应用特别有用。例如CLUT"Green"通常用于记录标有Alexa 488的标本, FITC 或其他类似的荧光染料,它们在绿色光谱范围内发光。另一方面,CLUT"Red" 是 used for samples stained with TRITC, Texas 红, Cy3, or other similar fluorescent dyes, 发射 ting light within the red spectral range.
"CMYK"是一种特殊的颜色查询表,用于处理 CMY K 色彩空间,一般用于打印机系统的彩色输出。
色彩空间(RGB,CMY,CMYK)
在每个成像系统(即监视器,打印输出)中,任何颜色描述都是基于单个基本颜色的组合。成像方法通过加色和减色混合来区分。例如,在黑色监视器屏幕上,必须 发射 某种类型的光以产生给定的颜色。在这种情况下,光的类型基于 r ed, g 保留或 b e( RGB )。
如果所有三种颜色都亮起,则创建白色。如果关闭所有三种颜色,则会创建黑色。人眼以及数码相机和监视器都适用于RGB模型。
另一方面,打印机使用减色混色,因为在像纸这样的材料表面上,必须从白色基材(纸)反射光。结果,打印机需要计算必须添加哪种墨水才能与白色基材一起产生给定的颜色。在这种情况下, c , m agenta和 y 埃洛( CMY )–红色,绿色和蓝色的互补色–是光谱中所有其他颜色的基础。在此模型中,所有三种颜色的添加会导致黑色,而所有三种颜色的缺失会导致白色。
注意:实际上,黑色是作为单独的墨水打印的,以避免在彼此之间使用太多颜色,并获得更鲜艳的黑色印象。因此,颜色空间也称为 CMY K ,其中K代表键盘,这是一种特殊的黑色打印设备。
Contrast
图像的对比度取决于所描绘对象与背景之间颜色和强度的差异。用数学公式表示,对比 (C)可描述为比率 %) of 在 tensities (I).
如图所示,样本强度和背景强度之间的差异越显着,对比度将越好。
关于显微镜,为了产生对比,样本必须与光相互作用,例如通过吸收,反射,衍射或荧光。
Deconvolution
去卷积 是一种通过应用数学算法将散焦信息重新分配到显微图像中原始信息的技术。通过这样做,用户可以获得特定焦点级别的更清晰的图片以及他们感兴趣的结构的更逼真的3D印象。
Dwell Time
在共聚焦显微镜中,允许激光束在给定时间内扫描特定区域(在等效图像的像素尺寸内)。此时间称为驻留时间。可能的是,延长的保压时间会导致照片漂白并给样品造成压力。
Dynamic Range
Exposure Time
数码相机的曝光时间决定了相机芯片暴露于来自样本的光的持续时间。对于大多数成像应用,此时间取决于光强度,通常在几毫秒到几秒之间。
Gamma (Correction)
人眼对光的感知是非线性的。我们的眼睛不会察觉到两个光子的亮度是一个光子的两倍。我们只会认识到它们比一个要亮。与人眼相反,数码相机的光感 是 线性的。两个光子产生的信号量是一个的两倍。伽马可视为人眼与数码相机之间的联系。
这可以用以下术语表示,其中V 出 是输出(检测到的)亮度值和V 在 是输入(实际)亮度值:
V 出 = V 在 伽玛
通过更改伽玛(进行伽玛校正),可以使在线性记录相机的帮助下拍摄的数字图像适应人眼的非线性感知。大多数相机芯片均可完成此校正。此外,数字成像软件通常具有自己的伽马校正选项。
Intensity
强度是能量分类。在光学领域,术语辐射强度用于描述对象在每个时间和面积上发出的光能的数量。
Noise
噪声是所有测量固有的不良特性。对于科学图像,这是一个主要问题,因为它会影响您量化感兴趣信号的能力。成像时要考虑的最重要参数是 信噪比 这是图片中的噪声与您要收集的信号量之比。噪声可分为几类:
光学噪音:不必要的光学信号通常是由高背景染色引起的,从而导致样品制备不佳或样品自身荧光较高。
暗噪声: 电子在传感器中的热迁移与积分的长度成正比。可以通过冷却成像传感器或减少曝光时间来克服暗噪声。
读取噪音: 从相机传感器读出电荷时引入信号的电噪声源。可以通过减慢传感器的读出速率来降低读取噪声,从而降低最大可达到的帧速率,或者切换到更高级的帧速率。 传感器类型,即EMCCD和sCMOS传感器。
光子散粒噪声: 由光子撞击传感器的随机特性引起的任何光信号中固有的噪声。这仅在非常弱的照明应用中需要考虑。收集更多的信号可减少图像中散粒噪声的影响。
改善信噪比的最简单方法是通过集成更长或更长时间的照明强度来收集更多信号。这些方法并不总是可行的,此时要求使用低噪点相机。
Nyquist 的 orem
显微镜成像意味着从样品信号到数字图像的采样过程。奈奎斯特定理描述了采样过程的重要规则。
原则上,再现精度随着采样频率的提高而提高。
的 奈奎斯特定理 描述了采样频率必须大于输入信号带宽的两倍才能从采样数据中重建原始输入。对于数码相机,这主要体现在像素大小上。为了获得最佳结果,像素应始终比要解析的最小结构小三倍,换句话说,最小为3 每个可分辨单元的像素是优选的。
Pixel
相机中的像素是其传感器的基本感光单元。这适用于所有二维数组 感应器 包含