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Nanodroplet处理平台,可对10–100个哺乳动物江苏体彩进行深度和定量蛋白质组分析

纳米级或单江苏体彩技术对于生物医学应用至关重要。但是,当前基于质谱(MS)的蛋白质组学方法需要包含至少数千个江苏体彩的样品才能提供深度分析。在这里,我们报告了用于小江苏体彩群体蛋白质组学分析的nanoPOTS(在一锅中进行痕量样品的纳米液滴处理)平台的开发。 NanoPOTS通过将处理体积缩小到<200 nL以最小化表面损耗。当与超灵敏液相色谱-MS结合使用时,nanoPOTS可以分别从大约10至140个江苏体彩中鉴定大约1500至3000个蛋白质。通过合并MaxQuant的“运行之间匹配”算法,>从少至10个江苏体彩中始终可以鉴定出3000种蛋白质。此外,我们证明了来自1型糖尿病和对照供体的单个人胰岛薄片的〜2400种蛋白质的定量,说明了nanoPOTS在临床组织中空间分辨蛋白质组测量中的应用。

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朱Y,皮埃霍夫斯基PD,赵R,陈J,沉Y,摩尔RJ,舒克拉AK,Petyuk VA,坎贝尔-汤普森M,马修斯 CE认证 ,史密斯RD,钱文杰& Kelly RT

纳米液滴处理平台,可对10-100种哺乳动物江苏体彩进行深度和定量的蛋白质组分析

自然通讯 9,文章 number: 882 (2018)
//www.nature.com/articles/s41467-018-03367-w