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区块上的新存储库

单元:图像库– CCDB

但是,既然人们可以在万维网上自行发布,我们就必须自己去寻找那些可靠且致力于科学准确性的资源。广泛的科学学科在数据聚合中发现了巨大的好处。事实证明,早期的蛋白质序列数据库和核苷酸数据库对它们的领域具有不可估量的价值。尽管显微镜成像领域还处于后期阶段,主要是由于大图像数据集存储方面的技术问题,但该领域还是有一个新的参与者。细胞: 影像库.

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细胞带来的价值

作为显微镜图像数据的同行评审数据库,我们提供了必要的监督,以确保在The Cell中仅提供有效和可信的数据。这意味着您作为用户可以相信,您所得到的内容并未受到不当的操纵。

另外,在美国,有一些资助组织已经要求将由联邦资助的研究获得的所有数据公开提供。想象一下,研究人员开发网站来呈现其最终论文中未包含的所有图像所需的精力和基础架构。并考虑用户从一个站点到另一个站点移动的体验,每个用户都有自己的导航和搜索,并尝试访问他们感兴趣的数据。通过将图像提交给The Cell,研究人员可以轻松地满足这些要求以及在提供数据的同时在一个易于使用的一致系统中与他人的数据进行交互。

该单元还可以充当所有实验者显微镜数据的档案,以便实验室和其他实验室将来可以轻松地引用这些数据。硬盘上存储了多少信息  驱动器,埋在桌子上的文件夹下?该单元可以使其他人可以查询该信息,并节省重复进行的实验所花费的时间和金钱。科学过程要求共享结果,而细胞提供了共享所有结果的能力,而不仅仅是最终论文中的内容。

此外,作为一个真正的多媒体图书馆,Cell能够呈现期刊不希望在其补充信息站点上托管的其他视频。由于该单元是免费资源,因此这些额外的视频将始终可用。 

细胞提供的功能

除了上述提到的Cell可以为研究人员提供的价值外,该数据库还为用户(无论是研究人员,教育工作者,学生还是公众)提供了广泛的功能。

该单元利用Web图像浏览器(WIB)。 WIB是一种易于使用的直观方式,可以浏览高分辨率图像。它使用户能够缩放并查看这些图像中显示的详细信息。使用“细胞”的其他“详细查看器”,用户还可以浏览4D图像,既是Z系列又是时间序列。

此外,对于用户而言,还有一些还包含一些有用功能的免费帐户。使用免费帐户,用户可以定义兴趣区域,并在返回“单元”时,这些兴趣区域将使用最新图像进行更新,以便用户拥有自定义的主页。帐户还可以将照片标记到某些相册中,以方便参考 之后。用户可以根据需要或期望创建和定义任意数量的对象。

该单元具有一些非常令人兴奋的功能,这些功能计划用于这些当前功能的未来开发。用户可以与其他研究人员“成为朋友”,并与他们共享照片框。或者,寻找一组图像以解释有丝分裂的教育者可以与其他教育者共享一个照片盒。将来,可以通过个人订阅来访问“兴趣区域”和“高级搜索”,以便在将符合个人兴趣的图像输入系统后,电子邮件将提醒用户正在等待新图像。

Paramecium multimicronucleatum-收缩液泡复合物的视频。体内CVC填充/排出循环。在侧视图中观察到压缩细胞中的CV经历了充液(舒张)和排出(收缩)其液体含量的循环,这是因为CV膜融合了然后从质膜上分离出来,并带有一个radial臂。电影是由Tomomi Tani博士拍摄的,将差分干涉对比光学元件连接到Leica倒置显微镜。使用Leica Fluotar x63物镜(NA = 0.7)。该视频由Tanimi Tani和Richard Allen拍摄。  cellimagelibrary.org/images/9692

提交图像的方式

这样的资源与社区使用的资源一样有用。该小组需要研究人员的参与,不仅有助于图书馆的使用和发展,还需要提供有关可能需要的反馈。

首先,The Cell需要图像-不仅是已发布的图像(事实上,这些图像通常具有版权限制,但The Cell确实与一些发行者有安排)。有关更多信息,请参见 许可政策.

要提交图片,请使用The Cell的 在线上传功能 用于许多更常见的数据格式。如果有直接来自显微镜的数据或在线上传者未处理的格式,则Cell几乎可以肯定地使用 DataRollup软件。此过程也可以用于批量提交大量图像。该软件使用 生物格式.

加入The Cell社区的方式

首先,对于任何问题,意见或建议,请联系David Orloff([email protected]),图片库高级经理。

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该项目得到了美国国立卫生研究院国立普通医学科学研究所(NIGMS)授予美国细胞生物学学会的RC2GM092708奖项的支持。